Após a contratação de Jair Ventura para comandar o Vitória no restante do Brasileirão, o clube também decidiu o destino de Rodrigo Chagas. O treinador, que chegou a ser efetivado no time principal após breve passagem como interino, será assistente técnico fixo da comissão rubro-negra.
A informação foi divulgada por Pedro Sento Sé, do Bar FC, e Gabrielle Gomes, do GE. Rodrigo foi anunciado em 14 de julho de 2025 como técnico do time sub-20, substituindo Laelson Lopes, demitido após a eliminação para o Ypiranga nas oitavas do Campeonato Baiano da categoria.

À frente da base, dirigiu a equipe em três partidas da Copa do Nordeste Sub-20, somando duas vitórias e um empate. Pouco depois, ganhou a chance no profissional com a demissão de Fábio Carille. No comando interino, estreou com vitória sobre o Atlético-MG por 1 a 0, no Barradão, e acabou efetivado.
No entanto, foram apenas mais dois jogos, ambos com derrotas – para Fortaleza e Fluminense. Com a chegada de Jair Ventura, o Vitória contratou Mário Henrique para assumir o sub-20, impedindo o retorno de Rodrigo ao cargo anterior.
Agora, ele passa a integrar a comissão permanente, atuando ao lado de Cleber dos Santos e Emílio Faro, auxiliares que darão suporte direto ao novo treinador.
A permanência reforça o vínculo de Rodrigo Chagas com o clube, garantindo sua participação na rotina do elenco principal e na continuidade do projeto esportivo rubro-negro.

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